Сын священника (по др. источ. (послужной список) - его отец С. А. Попов - кол. ас., находящийся в отставке). Окончил Казанскую гимназию. В авг. 1767 П. принят на воен. службу в чине подпрапорщика, в марте 1768 произведен в сержанты; участвовал в походах против Польши (1769) и Турции (1770), при этом принимал участие в осаде и взятии крепости Бендеры. В 1770 произведен в аудиторы. С 1771 по 1782 состоял при кн. В. М. Долгорукове-Крымском; сопровождал его в крымский поход и оставался в кач-ве секр. до окончат, покорения п-ва и заключения Кучук-Кайнарджийского мира (1774); произвел, в секунд-майоры (1775), занимал в штабе Долгорукова место правителя его походной канд., а в янв. 1780 переведен в Казанский пех. полк и назначен в Москву правителем ген.-губернатор, канц. при Долгорукове. В авг. 1781 произведен в премьер-майоры, а в мае 1782 - в подполк. После смерти Долгорукова П. обрел еще более могуществ. покровителя в лице кн. Г. А. Потемкина. В апр. 1784 произведен в полк, с причислением сверх комплекта к Таврическому легко-конному полку, одновременно "назначен состоять" при Потемкине. Неотлучно находился при нем, став его приближенным и доверенным лицом, зав. канд., выполняя все поручения как служебного, так и частного характера.
По рекомендации Потемкина в сент. 1786 П. "назначен состоять при Особе Ее Величества у принятия прошений", вместе с тем в собственноручном письме от 24 сент. 1786 к Потемкину Екатерина II "соизволила", чтобы "находящийся при нас у принятия подаваемых прошений и прочих дел полковник Попов остался. при вас для исправления всего от вас ему поручаемого". Благодаря Потемкину П. достиг высших ступеней в гос. иерархии. В 1786 ему пожаловано м. Решетиловка в Екатеринославской губ., и тем самым было положено основание его будущих богатств. В 1787 произведен в бригадиры, в 1788-91 вместе с Потемкиным принимал участие в турец. кампании, при этом дважды был командирован в Петербург с подробными донесениями о взятии Бендер (нояб. 1789) и Измаила (февр. 1791). В авг. 1791 вслед за Потемкиным выехал в Новороссийский край, в упр. к-рым принимал деятельное участие.
После смерти Потемкина (5 окт. 1791), прибыв в Петербург 12 янв. 1792, П. был оставлен Екатериной II в должности "состоящего при Ее Императорском Величестве". С авг. 1793 он - упр. Кабинетом е. и. в., а в нояб. 1793 ему подчинены Колыванские и Нерчинские заводы, принадлежавшие Кабинету.
С нояб. 1794 Гос. совет при Екатерине II принял решение доставить в Петербург гос. арх. и б-ку братьев Залуских, взятые войсками А. В. Суворова при вступлении в Варшаву. В июне 1795 кн. и рукописи начали прибывать в Петербург и поступили в ведение П. Он назначил служивших при Кабинете чиновников, знающих иностр. яз., к ее разборке и приведению в порядок; наблюдение за работой возложил на Ф. И. Киршбаума. Тогда же, в июне 1795 по приказу Попова был произведен первый отпуск сумм на постройку здания будущей Б-ки по проекту, выполн. Е. Т. Соколовым и утвержд. еще 16 мая 1795. В марте 1796 Попов подал на имя Екатерины II докл., в к-ром кратко изложил план создания нац. б-ки России. После вступления на престол Павла I Попов 28 янв. 1797 уволен от должности упр. Кабинетом, а 8 февр. того же года назначен "присутствовать" в Мануфактур-Коллегии, занимая в ней место после пред. В 1797 назначен президентом Камер-Коллегии, а в нояб. 1798 ему "повелено присутствовать" в 1-м деп. Сената. По доносу одного из недоброжелателей был предан суду, 26 авг. 1799 "отрешен" от должности президента Камер-Коллегии, поселился в деревне.
В нач. 1807 по повелению Александра I вызван из деревни и командирован в действ. армию к ген. Л. Л. Беннигсену для приведения в порядок интендантской части. После поражения рус. армии при Фридланде (2 июня 1807) ему было поручено на месте оценить обстановку и, в случае признания необходимости заключения перемирия с Наполеоном, передать главнокомандующему рус. армией Беннингсену письмо имп. с разрешением на ведение переговоров. Во время встречи Александра I с Наполеоном в Тильзите (июнь - июль 1807) Попов находился в свите имп. 22 июня 1807 назначен управляющим сначала Комиссариатским, а затем и Провиантским деп. С янв. 1810 П.- чл. Гос. совета, а 19 апр. 1812 получил пост пред. Комис. прошений. Кроме того, он был присутствующим в Совете, учрежд. при Воспитат. о-ве благородных девиц. В сент. 1818 избран почет, чл. Рос. АН, а 4 нояб. 1819 назначен пред. Деп. духовных и гражд. дел Гос. совета.
Награжден орденами: Владимира 1-й и 3-й степени, Анны 1-й степени, Александра Невского. Имел чин д. т. сов.
Похоронен на Лазаревском кладб. Александро-Невской лавры в Петербурге.
Справ.: РБС; Старчевский.
Лит.: 200-летие Кабинета Его Императорского Величества, 1704-1904: Ист. иссл. СПб., 1911.
Некр.:ОЗ. 1822. Ч. 12, кн. 32.
Арх.: Арх. РНБ. Ф. 1, оп. 1, 1795, № 1; ОР РНБ. Ф. 609.
Иконогр.: 200-летие Кабинета...; Суворов А. В. Письма. М., 1986.
А. М. Третьяк