Вновь образована как самостоятельная административно-территориальная единица указом имп. Александра I от 22.4(4.5).1805. Первоначально делилась на 5 комиссарств: Верхневилюйское, Верхоянское, Олёкминское, Среднеколымское, Якутское. Административный центр – г. Якутск. Входила в состав Сибирского генерал-губернаторства (1805–1822), Восточно-Сибирского генерал-губернаторства (с 1887 Иркутского генерал-губернаторства) (1822–1917).
Указом имп. Николая I от 2(14).12.1849 в состав Якутской области включён Охотский округ, который затем указом имп. Александра II от 8(20).12.1858 был включён в Приморскую область.
На юго-западе Якутская область граничит с Иркутской губернией, на юге — с Амурской, на юго-востоке — с Приморской областью. Восточная граница практически вся занята Камчатской областью.
Постановлением Сибревкома от 21.8.1920 Якутская область переименована в Якутскую губернию, через два года из нее создана Якутская АССР.