Всю осень 1941 г. сотрудники Библиотеки перемещали в целях сохранности в нижние этажи и подвалы Главного здания фонды Центральной справочной библиотеки, библиотеки читального зала, наиболее ценные коллекции эстампов. Большие передвижки были произведены также в зданиях резервных фондов, расположенных в Петропавловской крепости и Александро-Невской лавре. В общей сложности за короткий срок было упаковано, снято со стеллажей и перемещено около миллиона книг, журналов и других изданий и рукописей. Не следует забывать, что все работы приходилось выполнять в основном женщинам, поскольку бóльшая часть мужчин-сотрудников Библиотеки была призвана в армию.