Даже в условиях войны Публичной библиотеке выделялись в пределах возможного денежные средства на приобретение ценных собраний и коллекций. В их числе — библиотека чл.-кор. АН СССР физика В. С. Игнатовского, библиотека и архив М. М. Курбанова, архив академика живописи гравера В. А. Боброва, уникальные коллекции открыток Ш. Г. Чуракова и А. Ф. Сидорова.
В Книжной лавке писателей было приобретено большое число неизвестных до тех пор рукописных материалов ученых, писателей, политических деятелей, художников, композиторов, артистов. Среди них — автографы и письма Петра I, Екатерины II, А. В. Суворова, М. И. Кутузова, М. Д. Скобелева, М. Б. Барклая-де-Толли, Г. Р. Державина, Н. М. Карамзина, Л. Н. Толстого, П. И. Чайковского, Ф. И. Шаляпина.
Самой крупной покупкой военных лет было приобретение в 1943 г. библиотеки и архива Н. О. Лернера — одного из крупнейших исследователей жизни и творчества А. С. Пушкина — более 20 тыс. книг, брошюр, оттисков, журнальных вырезок, несколько тысяч вырезок из газет.